Все началось в последнюю среду августа 1945 года, когда несколько друзей наблюдали за парадом великанов, который проходил на главой площади города Буньоль. Ребята решили пристроиться среди музыкантов и выступающих парада, но совсем случайно они толкнули одних из выступающих на пол, те вскочив в гневе, начали разбивать и кидать всё на своём пути. По иронии судьбы там стояла лавка с овощами, которую люди разобрали и начали кидать друг в друга, пока правоохранительные органы не остановили эту "овощную" битву.

На следующий год эта группа друзей нарочно принесла помидоры из дома и повторила это мероприятие. Хотя полиция в последующие года и разгоняла участников, тогда ещё не официальной Томатины, эти несколько пареньков, сами того не зная, вошли в историю. Ла Томатина была запрещена в начале 50-х, что не помешало участникам продолжать её празднование, за что некоторые из их иногда были даже арестованы. Но в конце концов народ добился своего и Ла Томатину снова легализовали, благодаря чему она набрала всё больше участников и стала всё более радикальней.

Ла Томатина стала популярной во всей Испании благодаря репортажу Хавьера Басилио (Javier Basilio), выпущенным на испанском телевидении (Televisión Española) в 1983 году в программе Еженедельный Отчёт (Informe Semanal). С тех пор, из года в год количество участников Ла Томатины только увеличивается. Успех Ла Томатины стал таков, что в 2002 году она была объявлена Генеральным Секретариатом по Туризму, как Праздник Международного Туристического Интереса.